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了解聚糖

更新時間:2021-02-28      瀏覽次數:1042

了解聚糖

令人驚訝的是,一種聚糖似乎是引發整個開放的原因。

研究生Terra Sztain-Pedone和加州大學圣地亞哥分校的Rommie Amaro實驗室的同事以及匹茲堡大學的Lillian Chong的同事,精-確地研究了聚糖如何激活SARS-CoV-2。Sztain-Pedone將于2月25日星期四在生物物理學會第65屆年會上介紹這項研究。

使SARS-CoV-2(引起CO-VID-19的病毒)無法免疫系統的一件事是,它被稱為聚糖的糖所覆蓋。一旦SARS-CoV-2感染了某人的身體,它就會被該人*的聚糖所覆蓋,從而使免疫系統難以識別該病毒,因為它需要與之抗爭。這些聚糖在激活病毒中也起著重要作用。

研究小組使用可并行運行許多模擬的高級高性能計算算法,研究了隨著SARS-CoV-2尖峰被激活,這些原子中每個原子的位置如何變化。Sztain-Pedone說:“大多數計算機無法使用半百萬個原子來完成此任務。”為了使SARS-CoV-2活化并具有感染力,病毒外部的刺突蛋白需要改變形狀,以使其粘附在我們的細胞上。科學家們知道,覆蓋這些尖峰的聚糖有助于SARS-CoV-2逃避免疫系統,但尚不清楚它們在激活過程中起什么作用。研究這些分子非常棘手,因為它們是如此之小,并且有許多部分以微妙的方式運動。Sztain-Pedone解釋說:“在其中一種加標蛋白質模擬中,有500萬個原子。”

該團隊能夠鑒定出負責激活刺突蛋白的聚糖和分子。

 

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